然而，伏羲虽然是天纵奇才，可是，其终究还是人有穷时，随着人类的发展，人类再次出现食物危机。
而且，经过多年的发展，人类早已从原本居住在一起，变成一个个部落形式，这些部落虽然都是归伏羲管辖，可是，部落和部落之间也多有矛盾发生。
虽然没有演变成内斗，可是，长此以往，还是因为食物分配问题爆发了流血冲突。
而当年四个孩子被青云取名神农的孩子如今也长了一个青年，他所在的部落附近虽然有河流，可是，经过多年的竭泽而渔，河流中的凶兽早已被吃食一空。
这也导致神农的部落常年因为食物短缺而饿死大量的人。
神农不忍见族人如此死去，不顾燧人氏三人的反对，执意要求见青云，最后大吵一架后，不欢而散。
然而，神农并没有放弃，反而屡次偷偷前往祖地，想要绕过石屋，潜入青云所在的祖地中。
这一切都被青云看在眼里，青云无奈的摇摇头，吩咐神雕变小身体，化作一只鸟儿，叼着一株稻穗，在神农面前吃了起来。
神农原本正在疗伤，思索着该如何避开石屋中的燧人氏三人，找到青云时，看到神雕正在吃稻穗，好奇之下，神农来到神雕身边，仔细的观察了起来。
当神农看到神雕的模样时，作为青云的弟子，对神雕自然不陌生，当即知道是青云在指点自己，拿起稻穗后，对着祖地方向深深的躬了一礼，随后仔细研究稻穗。
最后，神农发现这稻穗剥开外皮后，里面白色的种子嚼在嘴里非常甘甜，思索一阵后，神农用水将稻穗种子煮熟，顿时，一股浓郁的清香传到神农的鼻尖。
神农当即大喜，然而，仅仅一株稻穗显然满足不了庞大的人类族群，神农思索一阵后，决定寻找类似稻穗的植物。
经过一年的寻找，神农终于找齐五种能被人类人体吸收的植物，分别是稻、黍、稷、麦、菽。
而在神农不懈努力下，燧人氏三人终于明白神农的苦心，给神农道歉，伏羲更是将共主之位传给神农，自己则去到石屋中，跟燧人氏三人作伴。
神农成为共主后，兢兢业业，不敢有丝毫懈怠，就连家中的妻子和孩子都忽略了，而在神农的努力下，人类也再次迎来飞速发展期。
然而，天有不测风云，神农虽然将五谷在人类中推广开来，可是，人类也因为食用五谷而变的体弱多病，神农自责的同时，也开始生出帮助人类治病的心思。
于是，神农放下一切，将族内的事情交给轩辕和蚩尤来管理，自己则开始踏上尝百草的路。
青云感知到这一幕后，叹息一声，吩咐纲手随行保护神农，以免让神农误食什么剧毒，而丧命。
虽然神农身上有浓厚的气运加身，可是，青云可不敢拿神农的生命去赌。
纲手得到青云的吩咐后，正好无聊的她也想找些事情做，也没拒绝，当即同意了下来。
而青云在纲手走后，继续开始打造承载武道的大殿。
这大殿想要坚不可摧，不仅需要青云的真元蕴养材料，更需要在其中注入青云的精神意志入其中，所以，耗费的时间极为漫长，即便过去了数十年，青云也才仅仅完成了一半。
然而，青云有种预感，一旦自己将这个承载武道的东西打造出来，那时，自己能获得巨大的好处。
这也是青云不懈努力的坚持下来的主要原因。
而在神农出去尝百草时，轩辕和蚩尤也兢兢业业的帮助神农处理人类的事务。
然而，两人的性格自小就大相径庭，面对部落间的争斗时，轩辕主张以和为贵，劝说相斗的部落各自退一步。
而蚩尤呢？
他则主张强者为尊，这个世界本就是弱肉强食，像那些凶兽一般，大型凶兽能肆意掠夺小型凶兽为食物。
而他们人类修炼武道，凭借智慧，也能掠夺凶兽为食物，所以，蚩尤每次处理这种事时，就主张让两个部落打一架，赢的获得战利品。
也是因为如此，让人族部落爆发大量的战斗。
蚩尤更是发明了铸铜之法，打造了大量的青铜武器，以此增加人类的攻击性。
有了这些利器后，人类部落间的动手从流血衍生到爆发生死战斗，随着死亡的人类越来越多，轩辕终于看不下去了，寻找蚩尤理论。
然而，蚩尤却认为轩辕嫉妒自己寻找到了带领人类强大的办法，对轩辕的劝说不理不睬，依旧我行我素，最后，实在受不了轩辕的蚩尤，带着忠于自己的手下离开人类祖地，另外开辟一地，并且，沿途收服大量的部落，俨然一副要重建祖地的打算。
燧人氏三人和伏羲察觉到人类即将分裂，终于意识到事情的严重性，可是，轩辕和蚩尤各有各的说法，这也是他们在轩辕和蚩尤争斗之初不知道如何调节的主要原因。
无奈之下，燧人氏三人和伏羲一起求见青云。
然而，青云只是说了句，这是人类该有的劫难，人类想要继续生存下去，就必须要经历各种磨难而打发。
事实上，青云也不知道轩辕和蚩尤两人谁对谁错。
轩辕想要和平解决族内的冲突，避免流血发生，这是好事。
然而，许多事情往往不是凭借嘴巴就能说清的。
蚩尤也没错，强者自然有享受丰厚资源的资格，弱者天生就是为了强者服务的。
这个道理是亘古不变的道理。
即便是后世，看似人人平等，可是，那只是换了种方式，弱者依旧是给强者打工，只是没有如今这么明显罢了，弱者有了许多选择，约束力没有现在这么强罢了。
燧人氏三人听到青云的解释后，只能无奈的回到石屋中闭关修炼，来个眼不见心不烦。
神农本在尝百草，经过数年的努力，神农将自身尝过的草药编撰成一本医经，然而，当神农想要继续尝百草的道路时，却听说人族发生分裂，神色大惊之下，只能施展身法急速的朝着人类祖地奔去。
在了解了事情的经过后，天性善良的神农毫不犹豫的选择支持轩辕，于是，一场人类间的内战陡然爆发。