林悦成功挫败神秘舰队企图获取起源之力的阴谋后，整个宇宙再次从危机边缘被拉回了和平的轨道。神秘舰队的残余势力被妥善安置，其所属文明在联军的帮助下，开始走上正轨，与其他宇宙文明展开友好交流。
林悦回到联军总部后，本以为能迎来一段稍长的安宁时光，全身心投入到对宇宙未知科技的研究中，为宇宙防御体系的进一步升级做准备。然而，命运似乎总爱给她出难题。
一天，林悦正在科研室里，与科研团队一起研究从神秘舰队战舰上拆解下来的科技部件。突然，整个总部的警报系统疯狂作响，灯光闪烁，红色警报光芒在各个角落跳跃。林悦立刻放下手中的工作，冲向指挥中心。
“报告林悦队长！”值班的副官神色慌张，“宇宙深处出现了一系列无法解释的能量波动，这些波动正以一种奇特的规律向着各个星系扩散，目前已经影响到了多个星球的生态平衡。”
林悦皱起眉头，迅速查看监测数据。能量波动的频率和强度都在不断变化，而且似乎蕴含着某种古老而神秘的信息。“立刻召集所有相关专家，我们需要搞清楚这到底是怎么回事。”
专家们很快齐聚指挥中心，大家围坐在巨大的全息屏幕前，紧盯着上面不断跳动的数据，展开激烈讨论。
“从这些波动的特性来看，它们不像是自然产生的宇宙现象。”一位资深的宇宙物理学家说道，“更像是某种强大的能量源被激活，正在向外释放信号。”
林悦微微点头，“不管是什么，我们必须尽快找到源头，阻止它对各个星系的影响。准备舰队，我们出发。”
舰队再次启航，向着能量波动的源头进发。在漫长的航行过程中，林悦和科研团队不断分析着越来越多的数据。他们发现，这些波动似乎与宇宙起源的某些古老传说有着千丝万缕的联系。
“传说中，宇宙起源时留下了一些神秘的遗迹，这些遗迹隐藏着宇宙最核心的秘密和力量。”一位研究宇宙历史的学者说道，“也许我们即将面对的，就是这样一个遗迹的苏醒。”
当舰队终于抵达能量波动的源头时，眼前的景象让所有人惊叹不已。一个巨大的、散发着五彩光芒的球体悬浮在宇宙中，球体表面布满了复杂的纹路和符号，每一道纹路都闪烁着神秘的能量光芒。能量波动正是从这个球体中源源不断地传出。
“这难道就是传说中的宇宙起源遗迹？”一名队员惊讶地问道。
林悦没有回答，她指挥舰队小心翼翼地靠近球体。就在舰队距离球体还有一定距离时，一群神秘的能量生物突然从球体周围出现。这些生物由纯粹的能量构成，形态各异，它们围绕着球体，发出强烈的能量波动，似乎在守护着它。
“看来我们的到来引起了它们的警觉。”林悦冷静地说，“准备战斗，但尽量避免过度冲突，我们的目的是搞清楚这个球体的秘密，而不是与它们为敌。”
舰队与能量生物展开了接触，这些生物对舰队的靠近表现出明显的敌意，它们发射出一道道能量光束，攻击舰队的战舰。林悦指挥舰队进行躲避，并尝试与能量生物进行沟通。
在多次尝试后，林悦发现这些能量生物似乎能够感知人类的思想。她集中精神，向它们传达和平的意图和对球体的好奇。渐渐地，能量生物的攻击变得缓和起来。
趁着这个机会，林悦带领一支小型登陆艇，缓缓靠近球体。在靠近球体的过程中，林悦感受到一股强大的吸引力，仿佛这个球体在召唤着她。
当登陆艇终于接触到球体表面时，一道强烈的光芒闪过，林悦的意识突然被卷入了一个奇异的空间。在这个空间里，她看到了宇宙起源的景象，无数的星辰在爆炸与诞生中循环，能量与物质相互交织，形成了宇宙最初的秩序。
接着，画面一转，她看到了各个文明的兴衰历程，以及神秘组织和神秘舰队为了获取宇宙力量而进行的种种疯狂行径。最后，画面定格在一个模糊的身影上，这个身影似乎在向她传达着某种重要的信息，但林悦却无法完全理解。
当林悦的意识重新回到现实时，她发现自己已经回到了登陆艇上，周围的能量生物正静静地看着她。林悦意识到，这个球体蕴含着宇宙最核心的知识和力量，但同时也隐藏着巨大的危险。
“我们必须保护好这个球体，不能让任何企图利用它的邪恶势力得逞。”林悦对队员们说道。
然而，就在这时，联军总部发来紧急通讯：“林悦队长，不好了！神秘组织的残余势力联合了一些对宇宙现状不满的势力，正在集结力量，企图抢夺这个宇宙起源遗迹。他们的舰队已经朝着你们的方向出发了。”
林悦心中一紧，她知道一场新的危机即将来临。“立刻返回舰队，做好战斗准备。我们绝不能让他们得逞。”
舰队迅速调整阵型，准备迎接即将到来的战斗。林悦站在指挥舱内，眼神坚定。她深知，这场战斗不仅关乎宇宙起源遗迹的安危，更关乎整个宇宙的未来。
神秘组织及其盟友的舰队很快出现在视野中，他们的战舰数量众多，火力强大。战斗瞬间爆发，激光炮和导弹在宇宙中交织成一片火海。
林悦指挥舰队巧妙地利用宇宙起源遗迹周围的能量环境，与敌人展开周旋。她发现，神秘组织的舰队在靠近遗迹时，似乎受到了某种力量的干扰，行动变得迟缓。
“利用遗迹的能量干扰他们的战舰！”林悦大声下令。舰队发射出一道道特殊的能量波，与遗迹的能量相互呼应，对神秘组织的舰队造成了巨大的干扰。
在激烈的战斗中，林悦发现神秘组织的首领似乎掌握了一种能够短暂控制遗迹能量的技术。他利用这种技术，试图突破舰队的防线，抢夺遗迹。
“不能让他靠近遗迹！”林悦带领几艘精锐战舰，冲向神秘组织的指挥舰。她施展出强大的能量攻击，与神秘组织首领展开正面交锋。
经过一番激烈的战斗，林悦终于找到了神秘组织首领控制遗迹能量的关键装置。她集中力量，发动致命一击，摧毁了装置。
失去了控制装置的神秘组织首领，再也无法利用遗迹的能量。神秘组织及其盟友的舰队在舰队的攻击下，逐渐陷入了混乱，最终被彻底击败。
解决了危机后，林悦带领舰队回到宇宙起源遗迹旁。她决定在遗迹周围建立一个永久性的监测站，派遣最精锐的部队和科研人员驻守，确保遗迹的安全。
回到联军总部后，林悦将这次的经历和发现详细汇报给了高层。经过商讨，联军决定将宇宙起源遗迹的存在告知各个文明，并共同制定了保护计划。
林悦也因此肩负起了新的使命，她成为了宇宙起源遗迹的守护者，带领着一支特殊的舰队，在遗迹周围巡逻和守护。她知道，未来的路还很长，宇宙中还有无数的未知和挑战等待着她，但她毫不畏惧，因为她深知自己的责任重大，为了宇宙的和平与安宁，她将永远坚守在自己的岗位上。