【小建：那可是还没转成研究员的大木博士，也是像小智一样出来旅行的，战斗天赋也是拉满，不然怎么成为联盟第一位冠军。】
【菊子：就是脑子不太好使，战斗天赋这么高，偏偏要隐退去做研究员，也不专注宝可梦对战】
【空木博士：不不，师父脑子很好使，是他主张用属性对宝可梦进行分类的，对宝可梦各个方面都有很大的影响意义，而且还是宝可梦达人和权威，也是一名格外出色的宝可梦训练家。但是他为人非常的低调很少去刻意去彰显自己实力，可能是觉得自己年轻的时候没有遇到什么对手，便转投研究宝可梦这个行业了吧。】
【小刚：好像还真是这样！大木博士选择不做冠军，是为了追求自己对宝可梦研究的热情，通过他的知识和经验来指导和帮助新一代的训练家！！！】
【大木博士：......】
大木博士表示我怎么不知道自己这么厉害。
......
白世界——
小智跟雪成赶回村子时森林中，突然冒起了白雾，圈圈熊走过来带路，随后小智一行人每到一处领地，引路的宝可梦就会换了一批，最后走到生命之湖，时拉比也在这里恢复过来。
时拉比痊愈后，跟雪成和小智玩耍了起来，而小智也与雪成成了好朋友。
但回去村子的途中，火箭队又过来抓走了时拉比，还用黑暗球收服了时拉比。
借助时拉比的力量制造出了草木巨人，然后到处破坏。
水君也过来帮助小智一行人，将小智跟雪成送进了邪恶体，从而唤醒了时拉比。
危机是解除了，但现在时拉比也因为黑暗球的暴走变得极度的虚弱，已陷入了衰老，身体状况又不好，即使是水君净化了湖水，但时拉比受到了太多的伤害，无法治愈。关键时候来自各个时代的时拉比出现在了生命之湖的上空，它们恢复了这只时拉比的生命。
最后，雪成与小智不舍地道别，与时拉比共同回到了四十年前。
最后一幕便是定格在了雪成画时拉比跟皮卡丘依靠在一起的褪色素描本上。
.......
“时光过得可真快！”
大木博士也翻着已经褪色素描本，脸上尽是怀念。
【花子：原来是这样的，我说小智怎么就拿到皮卡丘呢，原来是大木博士故意给小智的，看出了小智是他穿越后结交到的朋友。】
【大木博士：嗯，本来是留在心中当作秘密的，没想到被这个光幕给曝光了出来。】
【小智：大木博士，怪不得那时候跟你通电话，我们还没说雪成的名字，你就说跟我们说我跟雪成之间的友谊足以经得起时间的考验，那时候我们都还很好奇呢，原来雪成是你啊！】
【大木博士：那都很久了！】
众人看弹幕上的发言，感觉有点魔幻。
从真新镇出来的训练家的神兽缘都很好，而且还是穿越了时空。
四十年前的大木博士跟小智成为了朋友！
后面大木博士还记得好友的宝可梦皮卡丘，所以就将研究所里边潜力最不凡的皮卡丘交给了小智。
大木博士还留着与好友小智他们跟时拉比一起玩耍的时候记录下来的褪色素描本，要不是光幕曝光出来，大家都还不知道大木博士为什么一开始不送关东御三家给小智，绝对不是准备不充足，是故意将那只皮卡丘送给小智的。
这么厉害的宝可梦博士，怎么可能没有多备几只御三家呢。
......
白光幕还没有结束，休整过后，小智一行人以宝可梦大师为目标而持续旅行，这次为了参加水上竞赛，来到了水之都奥多马雷。
比赛中，小智与小锯鳄表现勇猛，开始追上了前面的小霞，实则是拉帝亚斯帮助他们。
只可惜刚冲上第一不久，却是意外地被拉帝亚斯带偏路线，导致无缘冠军。
即使是无缘了冠军，小智也没有失落，温柔地安慰失落的小锯鳄。
拉帝亚斯与拉帝欧斯就隐形在空中看着小智安慰小锯鳄。
又是神兽......小智这个家伙的神兽缘也太好了吧，一路上都遇到了多少宝可梦，而且还是帮助了那些宝可梦，从而跟它们产生了更加深厚的缘分。
最后是小霞拿下了这个比赛。
皮卡丘遇到了一个女孩，后面小智跟上来，那女孩凑上去，仔细地观察小智，还绕着小智转了一圈，对小智很是感兴趣。
随后怪盗姐妹桑娜、莉安用跟在那女孩后面，用那高科技眼镜才看到了那女孩是拉帝亚斯变的。
......
【马志士：小智那是神兽亲和体质吧，拉帝亚斯居然变成了女孩跟小智见面。】
众人都没想到拉帝亚斯居然变成了女孩，还过去亲近小智。
【小次郎：要是跟小鬼头学学，那我们是不是也可以见到很多神兽，跟它们产生了羁绊，那不就可以让它们加入火箭队，我们岂不是很容易称霸世界。】
【武藏：小次郎，你真是一个天才，走小鬼头的路，收传说中的宝可梦是吧，这个想法简直不要太好。】
【喵喵： 这么一想，以前吃了那么多苦，现在终于是苦尽甘来！】
【小胜：得了吧，你们是傻的，但人家神兽可不傻，怎么会不知道你们想要干坏事的想法，你们是学不了小智的，还是专心当搞笑艺人吧！】
焯！
这个小小鬼又在诋毁他们，信不信他们去炸了那个道馆！
看到搞笑艺人这个几个字，火箭队三人组像是被被踩到尾巴的猫一样。
“这个小鬼比小鬼头还讨厌，早知道当初在丰缘地区就针对这个小鬼。”
武藏气愤地说道，“不行，我忍不了这口气，必须得要教训一下他！”
“他爸是橙华市道馆的馆主，千里。”
小次郎想了想，说道。
“那没事了！”
......
随后拉帝亚斯却是找遭到了怪盗姐妹桑娜、莉安的抓捕，用吐丝限制住了拉帝亚斯，而小智可不皮卡丘过来就救下了拉帝亚斯。
逃脱危险后，小智就在博物馆中遇到了本葛雷先生，了解到奥多马雷防御装置，刚好遇到了先前救下的女孩，误打误撞地跟随女孩来到了神秘的花园。
在这里，小智才知道那女孩原来是拉帝亚斯。
拉帝亚斯很喜欢小智，想要跟小智一起玩耍！
......
拉帝亚斯......小霞觉得拉帝亚斯对小智不是单纯地宝可梦对训练家的喜欢，类似菊草叶喜欢小智那样的，甚至还要超过菊草叶！