黑小智一行人来到了月见山，见到尼比市科学博物馆的研究员尼卡，探查月见山的情况。
因为月见山的月之石太出名，很多人过来找寻月之石，从而月见山的宝可梦们的生存环境遭到了破坏，宝可梦们因此受到了很大的影响。
【小刚：我记得这个研究所小哥，他认为皮皮是来自外星的，而当时月见山上出现月亮石的消息传遍关东，人们都来月见山这里淘宝，火箭队三人组自然没有放过这个发家致富的机会，不过后面也是被我们给赶走。】
【小智：我也记得，你就是那时候收服了超音蝠。】
【小霞：火箭队他们还真是阴魂不散，这次想抢夺皮皮的月之石。】
【武藏：你们三个小鬼是真的可恶，别人都可以拿，为什么我们火箭队就不能拿，你们三个是不是针对我们！】
【小次郎：就是！！！】
【喵喵：可恶的小鬼头，我们赚点钱你也要管喵！】
【小智：喵喵？你也能发弹幕？】
【希巴：诶？是不是火箭队的喵喵吗？】
【小刚：是啊，喵喵会说话够稀奇，但没想到喵喵居然能够发弹幕，难道喵喵是天选的宝可梦？】
此时，武藏跟小次郎仔细端详喵喵。
左看右看，怎么看喵喵除了会说人话，动手能力强些，就好像没有其他特别的地方。
“看什么喵？”
注意到两人的目光，好像带有一丝诧异，喵喵问道。
“你也能发弹幕？”
“当然喵!”喵喵露出了高傲的表情。
就在武藏他们讨论喵喵会发弹幕的时候，黑世界的火箭队三人组抢夺月之石被小智一行人给发现，还想顺手抓走平皮卡丘的。
不过，他们也只是想一下，皮卡丘一看到火箭队三人组，就知道他们想要十万伏特，立马将他们的宝可梦打败，一发十万伏特送走他们。
一大群皮皮走过来，给小智他们一人送一块月之石。
小智还特意放出宝可梦，让它们跟皮皮多玩玩，他则是跟尼卡研究员学习关于宝可梦生存环境的知识，想要看看自己还有哪些地方做得不好，要给皮卡丘它们改善一下。
“小智也太勤奋了吧！”
小刚感叹一下，搞得他莫名有一股压力，也过去学习一下，毕竟他是要当培育家的，关于宝可梦的知识自然需要了解很多。
【希巴：黑小智是真的卷，样样都要学，他难道是想要涉及关于宝可梦的整个领域吗？真是这样的话，那也太离谱了吧！】
【小刚：希巴大师，我看黑小智就是有这样的打算，先是跟黑世界的我学习做宝可梦美食、学习给宝可梦按摩，现在还跟研究员学习宝可梦的生存环境知识，他对于有关宝可梦的事情都很上心。】
【小霞：我看黑小智就算不当训练家，凭他这股学习的念头，完全可以当一个研究员。】
【大木博士：说得对，黑小智这个劲头比我还要疯狂，估计不久后，黑小智不仅是传奇训练家，还是更厉害更出名的宝可梦研究员呢。】
【小智：另一世界的我这么厉害，那我也要努力，争取拿到密阿雷大会的优胜。】
【艾岚：我很期待能在决赛遇上你！】
.......
跟皮皮们告别后，小智一行人来到了华蓝市。
小霞跟小智旅行想了很多，主动透漏出自己身份。
她本就是华蓝市道馆的人，是三位美女馆主的妹妹。
小霞离开道馆前就放下了狠话，说要在成为水系宝可梦大师之后再回来。
但一想到那三位没有斗志的姐姐，小霞便决定还是自己迎战小智。
一路上跟小智旅行，都看到小智带着皮卡丘它们训练，小霞就想看看皮卡丘它们训练之后有多强。
以后自己收服水系宝可梦，也可以学习一下小智的训练方式，那样自己就能更快地成为水系宝可梦大师。
小智他们还没开始对战，火箭队提前过来捣乱，但很快被皮卡丘给打走。
幽默的火箭队开场表演结束，对战场地完好如初，道馆挑战赛继续进行。
小智派出巴大蝴、比雕跟小霞对战，飞行系对战水系。
宝石海星也算是半个飞行系的，它能转动自身飞行。
结果是巴大蝴跟比雕大胜小霞的海星星跟宝石海星。
小智成功拿下了第二枚徽章，华蓝道馆的蓝色徽章。
小霞的三位姐姐见到小霞的实力，便让小霞继续跟小智旅行，道馆就交给她们。
打完了华蓝道馆后，三人前往枯叶市，枯叶道馆。
路上就遇到了好几个训练家，他们都是被个人道馆‘猛兽使’小明给打败。
小智他们还看到了火箭队他们也来挑战，不过输得很惨。
他们被皮卡丘接连打败，想要出出气的，刚好看到这里有人挑战连胜，他们火箭队想来挫挫这个训练家的锐气，但这个穿山鼠很强，他们对付不了。
小智上去终结猛兽使小明的连胜，无论穿山鼠使出什么招式，皮卡丘都能应付。
穿山鼠使用滚动，皮卡丘用铁尾像是踢足球那样，将穿山鼠给打飞。
穿山鼠挖地，钻入洞里，皮卡丘就用铁尾击打地面，将穿山鼠给打出来。
“我的九十九连胜！！！”
猛兽使小明失意orz状半跪在丧失战斗能力的穿山鼠身侧。
皮卡丘看到这里有训练器材，闲着无聊去弄一下穿山鼠的宝可梦强制锻炼器。
用尾巴轻轻举起来，上下移动。
猛兽使小明一惊，皮卡丘这么轻松地用尾巴将这个极具重量的宝可梦强制锻炼器给举起来。
他立马将牌子上显示的九十九连胜改成零，要重新开始挑战，不到一百连胜不离开这里。
他带着穿山鼠回到后面的训练帐篷，进行更加刻苦的训练，皮卡丘用尾巴举起来那么重的宝可梦强制器，想要让穿山鼠也能这样做！
又卷了一个！！！