在特别行动预备队成功化解与未知文明的冲突后，宇宙似乎又恢复了往日的平静。然而，这种平静并没有持续太久，一场新的危机正在悄然降临。
特别行动预备队的情报部门收到了一系列令人不安的消息。多个星系出现了异常的能量波动，一些星球上的生态系统突然崩溃，还有神秘的飞船在星系之间频繁穿梭，行踪诡秘。
莉亚立刻召集队员们进行紧急会议。“这次的情况十分复杂，我们必须尽快找出这些事件背后的关联。”
汤姆皱着眉头分析道：“从目前的情况看，这很可能是有组织、有预谋的行动，但幕后黑手的目的尚不明确。”
艾米补充说：“我在对这些异常数据进行分析时，发现了一些奇怪的代码，似乎是一种高级的控制指令。”
卡尔担忧地说：“难道是又有新的强大势力在试图破坏宇宙的和平？”
为了查明真相，特别行动预备队决定分头行动。杰克带领一支小队前往能量波动异常的星系进行实地勘察，莉亚则与艾米一起深入研究那些神秘代码。
杰克的小队在目的地发现了一些废弃的实验基地，里面充满了各种奇怪的仪器和生物样本。“这里一定进行过某种危险的实验。”杰克心中充满了疑惑。
而莉亚和艾米经过日夜不停地努力，终于破解了部分神秘代码的含义。“这些代码指向了一个跨星系的巨大阴谋，有人在试图操控宇宙的能量平衡。”莉亚说道。
与此同时，特别行动预备队发现，一些星球上的居民开始出现奇怪的症状，仿佛受到了某种精神控制。
“这太可怕了，如果不及时阻止，后果不堪设想。”汤姆说道。
特别行动预备队感到前所未有的压力，但他们并没有退缩。在紧张的调查中，他们逐渐发现了一个隐藏在宇宙黑暗角落的神秘组织。这个组织拥有着超越当前科技水平的力量，企图通过制造混乱来实现他们统治宇宙的野心。
“我们不能让他们得逞！”卡尔愤怒地说道。
特别行动预备队决定主动出击，与这个神秘组织展开一场决战。他们制定了详细的作战计划，准备一举摧毁敌人的阴谋。
在战斗前夕，队员们互相鼓励。“这是我们的使命，为了宇宙的和平，我们无所畏惧！”莉亚说道。
当战斗打响，特别行动预备队展现出了无比的勇气和顽强的斗志。他们与神秘组织的力量展开了激烈的对抗，每一个队员都拼尽全力。
在关键时刻，特别行动预备队发现了敌人的致命弱点。他们集中力量发起了最后的攻击，终于成功击败了神秘组织，拯救了宇宙。
“我们胜利了！但我们不能放松警惕，要为宇宙的和平永远守护。”莉亚的声音在战后的废墟中响起，特别行动预备队的队员们再次坚定了他们守护宇宙的决心，迎接未来的挑战与希望。