六月初五，李克用统率河东军浩荡南下！
对外声称王行瑜、李茂贞、韩建三人，无故兴兵侵犯京师，擅杀朝廷重臣，罪大恶极，奉旨征讨。
大军进至绛州（山西运城新绛县），刺史王瑶据城固守。李克用发兵攻打，十多天后城池陷落，王瑶被拉到军门前斩首示众，城中敢违令抵抗的一千余人也一并惨遭诛杀。
七月初一，李克用抵达河中。
王珂率众于路旁迎候，有了这位骁勇无双的岳父支持，他的河中节度使是当定了！什么嫡子、庶子，什么亲生、收养，在绝对实力面前都不过是个笑话！
七月初三，匡国军节度使王行约在朝邑（古地名，距陕西大荔县十六公里）被河东军所败，退出同州（陕西渭南大荔县）逃往京城，与时任神策左军指挥使的弟弟王行实在长安城内疯狂抢掠。
王行实谎称同、华二州已失，沙陀人将至，请昭宗临幸邠州（陕西咸阳彬州）；枢密使骆全瓘，则力劝昭宗移驾凤翔。
王行实代表的是占据邠州的王行瑜，骆全瓘则代表割据凤翔的李茂贞。他们殷勤劝说昭宗莅临自己的地盘，并不是什么良心发现，不过是想过过“挟天子以令诸侯”的干瘾罢了！
对此昭宗看得很透，自然不愿受他们所制，回复道：“朕已收到李克用奏章，他目前还在河中。而且即便他到了长安，朕也自有办法。你们只需管好部伍，不要再四处惹事生非即可。”
神策右军指挥使李继鹏是李茂贞的义子，与骆全瓘合谋劫持昭宗到凤翔。与此同时，神策军中尉刘景宣和王行实，则想把昭宗劫往邠州。
当晚，李继鹏接连奏报军情紧急，逼迫昭宗移驾。王行约、王行实率领左军攻打李继鹏，双方战在一处，鼓噪声震天动地。
昭宗听闻动乱，登上承天楼，想要颁旨劝谕。禁军将领捧日都头李筠率本部士卒赶来，在楼前护驾。李继鹏带着凤翔兵攻打李筠，激战中一支流箭射向承天楼，擦着昭宗衣?而过，钉在门墙上，左右亲信急忙扶着昭宗下楼。李继鹏纵火焚烧宫门，烟尘遮天蔽日。
危难中，在长安驻防的一支盐州边军（陕西榆林定边县）赶来护驾，神策左、右军这才各自撤走。
城中秩序大乱，昭宗带着皇室宗亲躲到李筠营中。护跸都头李居实也率本部支援，形势有所缓和。
昭宗听说王行瑜、李茂贞要来迎驾，担心被他们挟持，遂在李筠、李居实的护卫下撤往终南山，暂驻于莎城镇（陕西西安长安区东南）。
长安市民跟随前来的有数十万人之众，到达谷口由于天气炎热，渴死了近三分之一。夜晚时分，市民又遭到乱匪抢劫，哭声响彻山谷。
七月初七，李克用进入同州（陕西渭南大荔县）。
七月初九，昭宗迁往石门镇（陕西西安蓝田县西南五十里），派薛王李知柔返回京城守卫宫禁。
七月十一日，李克用派判官王瑰前来问候昭宗起居。
七月十二日，安定下来的昭宗派内侍郗廷昱颁旨李克用，令他与王珂出兵进击邠州，对付王行瑜。又诏令泾原节度使（治所位于甘肃省平凉市泾川县）张鐇发兵，控扼凤翔。
李克用率兵攻打华州（陕西渭南市华州区），韩建在城楼对着攻城的河东军大声呼喊：“我从未做过对李公无礼的事，为什么打我？”
李克用派人转告他：“你身为人臣，竟敢驱逐天子，如果这都能叫有礼，什么才是无礼！”
这时郗廷昱赶来告之李克用，李茂贞率三万人进抵周至（陕西西安周至县，在长安西南），王行瑜领兵到达兴平（陕西咸阳兴平县，在长安西北），都说要劫持圣驾。李克用这才解除华州包围，率军屯驻渭桥（长安附近）。
八月初五，李克用派大将李存贞为前锋，从渭桥进发。另派大将史俨，率三千精骑，驰奔石门护驾（陕西西安蓝田县西南五十里）。
初七，李存贞攻占邠宁所属永寿县（陕西咸阳永寿县）。
初九，李克用将领李存信、李存审，会同鄜坊节度使（治所坊州，即陕西延安黄陵县）拓跋思孝，向梨园寨（陕西咸阳淳化县）发起猛攻，生擒李荗贞所部将领王令陶等人。
李茂贞深知沙陀“鸦军的”厉害，当即把干儿子李继鹏斩首，将他首级送到石门向昭宗请罪，同时派使者找李克用讲和。
昭宗想让李茂贞领情，答应不再追究。又派李戒丕、李允两位亲王前往劝说李克用，让他放过李茂贞，合力进讨王行瑜，并拜李克用为兄长。
八月十四日，王行瑜被撤销官爵。
十九日，诏令李克用为邠宁四面行营都招讨使，统一指挥河东、鄜坊、泾原、夏绥四镇军队，征讨王行瑜。
李克用让年仅十一岁的儿子李存勖到石门拜谒昭宗，昭宗见李存勖小小年纪却英气勃发，不禁拍着他的背说：“孩子你是国家栋梁，将来一定要效忠我大唐！”
李存勖牢牢记住了这句话，后来他攻灭后梁统一北方，在魏州（河北邯郸大名西）称帝，仍沿用“唐”为国号，以示自己是李氏唐朝的合法继承人。
九月十八日，李克用率军继续猛攻梨园（陕西咸阳淳化县）。王行瑜向李茂贞求援，李茂贞派万余人屯驻于梨园以北的龙泉寨（陕西咸阳旬邑县东北），自己带三万人屯驻咸阳，从南、北两个方向声援梨园。
李克用奏请昭宗下令让李茂贞撤军，免去官爵，并分兵打他。昭宗认为李茂贞杀了干儿李继鹏请罪，刚刚才赦免，此时不宜撤职征讨。只下令李茂贞返回本镇，与李克用讲和。
十月初三，河东大将李存贞在梨园北击败邠宁军，斩杀千余人。梨园守军自此闭关固守，不敢再出城交战。
李克用令黄巢降将李罕之、义子李存信强攻梨园。城中食物吃光，守军被迫弃城逃走。李罕之等乘胜追击，斩杀万余人，连克三座营寨，抓获了王行瑜之子王知进及大将李元福。
十月初七，李克用进占梨园。
王行约、王行实放火烧毁宁州（甘肃庆阳宁县），逃遁而去。
王行瑜率五千精锐甲兵驻守龙泉寨（（陕西咸阳旬邑县东北），李克用挥师猛攻。李茂贞出兵救援，被李罕之击溃。
十一月初五，龙泉寨失守，王行瑜逃入邠州（陕西咸阳彬州），派使者向李克用请降。
李克用进兵邠州，走投无路的王行瑜登上城楼号哭着对李克用说：“我没罪啊，胁迫天子的事，都是李茂贞和他儿子李继鹏干的，请您派军队攻打他们，我自己到朝廷请罪！”
李克用不屑地说：“王尚父你太谦虚了！我受诏讨伐三贼，你是其中之一，到朝廷自首？这恐怕不是我能决定的事！”
十一月十五日，王行瑜弃城逃走，在庆州（甘肃庆阳市庆城县）被部下所杀。
十二月初三，李克用凯旋，屯驻于云阳（陕西咸阳淳化县北）。
十二月十三日，朝廷犒赏功臣，进封李克用为晋王，其他参与作战的将领也各有封赏。