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随着帖木尔帝国各地逐渐被明军占领与控制，其余地方的卫戍部队不是投降，就是被彻底消灭。战争的进度之快，让朱祁钰都有点不敢相信，特别是在哈烈城被明军攻陷之后，帖木尔帝国各地的军队几乎都没有任何要打败明军的想法。在西北军团与蒙古军团横扫了这个从印度河流域到两河流域，从阿拉伯海到里海的庞大帝国时，一个新的问题也出现在了朱祁钰的面前：这么一个庞大的国家，是吞并，还是扶持新的政权？或者说，怎么来控制这一块明军新占领的土地！
攻打帖木尔帝国的初衷并不是要占领这个国家，朱祁钰甚至没有想过要吞并这么一个庞大的国家。从帝国的行政控制能力上来看，随着蒙古部落向西北方向，也就是乌拉尔山脉方向前进，帝国疆土已经扩大了很多，而中央政府对偏远地区的管理能力是非常薄弱的，往往只能派遣少数官员前去，要半年，甚至一年的时间，官员才能回京述职一次。显然，如果帝国的疆土再扩大的话，那么在行政管理上必然出现很大的问题！
朱祁钰也没有考虑行政管理上的麻烦，他考虑问题的方式很直接，那就是帝国有没有能力控制这片领土，而且有没有必要控制这片领土。在他所考虑的“能力”中，军事能力是最重要的。
随着帝国疆土的扩大，以及在南洋，西洋等地的据点陆续建立了起来，大量的帝国军队不得不驻扎到国外去。比如，在日本叛乱之前，部署在日本的地面部队就超过了十万人，虽然在叛乱之后。只留下了第五集团军的一个军在日本，地面部队规模缩小到了三万多人，不过，在朝鲜，济州岛。琉球王国，南洋的众多土着王国，华侨共和国，还有设在各地的据点，都要留守部队。到这时，帝国部署在海外地军队数量已经达到了二十五万。这还没有算上海军的兵力，如果将在海外作战，或者部署的三支舰队，还有数支陆战队算上的话。那么帝国部署在海外的总兵力已经超过了四十五万！
以当时帝国地国力来说，支持一支超过两百万的军队是没有半点问题的，不过除掉了帝国各地的卫戍部队之外。中央军的总兵力。即海军与陆军的总兵力最多只能达到一百五十万，如果超过了这个数字，则军队的素质必然下降，而且国力难以承担。那么，这一百五十万部队是个什么概念呢？
首先，部署在海外的军队数量就达到了四十五万，在南方平定苗人叛乱的军队大概有五万。在京城轮休地军队大概有二十万，在塞外监督日本劳工筑路的军队数量将在五万到十五万之间。除去这一部分之后。剩下的就是朱祁钰能够用来发动对外战争地军队数量了，有多少？六十五万到七十五万之间。
显然。这样一支部队，足以击败任何一个敌人，并且控制很大一块占领区了，不过，能将其用来占领帖木尔帝国吗？朱祁钰显然也认识到了这一点，既然攻打帖木尔帝国地最终目的不是为了占领这个国家，那么为什么要占领这个国家呢？如果要占领帖木尔帝国的话，就至少要动用二十到三十万的地面部队，而且这还无法完全保证各部队能够顺利的镇压各地的抵抗者组织。而剩下的三十多万军队能做什么？战胜帖木尔帝国只是西征地开始，如果在这里就耗费了大量的军力，那今后地仗怎么打？
考虑得更深入一点之后，朱祁钰也发现，如果占领帖木尔帝国，甚至是吞并了帖木尔帝国之后，那就将面临一个更严峻的挑战：今后占领地领土也要并入帝国吗？显然，这个问题不难回答，不过结果却是最糟糕的。
任何一个庞大的帝国都不是一日型成的，不说对外，仅明帝国从建立到最后巩固，都花了几十年的时间，而且这还是在国内，民族条件单一的情况下。相反，如果是在国外，而新占领区的民族并不认同被明帝国吞并的这一事实的话，那么就必然引发这些民族进行抵抗。远的不说，在日本，就因为这一原因，导致明帝国动用了数十万军队，耗时近两年，才平定了日本的叛乱。相对而言，日本还只是一块很小的占领区，面积不大，人口也不多，这就需要让明帝国花费巨大的力量来镇压，那么占领了更多的土地，控制了更多的国家之后，同样的事情也无法避免，更不可能杜绝，到时候，明帝国要花多少力气用来镇压呢？
当然，还有一个选择，那就是逐步扩张，而不是一口气吃得太多，可是，朱祁钰并没有这么多的时间来逐个的达到自己的目的，毕竟人的寿命是有限的。明帝国战胜日本已经有六年了，而且现在日本的局势都没有完全平息下来，那么，要彻底控制帖木尔帝国这么大的一块土地，需要多久？十年，还是二十年？不管是十年，或者是二十年，朱祁钰都没有这么多的时间浪费在这里。
帖木尔帝国是一个庞大的帝国，而且是一个通过扩张与侵略建立起来的帝国。这个庞大的帝国与明帝国本身有着巨大的差别，特别是在人口结构方面的差别非常大。在明帝国，占主体地位的是汉族，汉族人口占了明帝国总人口的九成以上，也就是说，明帝国虽然是一个拥有数十个少数民族的多民族国家，不过实际上是一个单一民族国家。相反，帖木尔帝国中，居于统治地位的突厥一蒙古后裔是真正的少数民族，其他民族所占的比例远远大于占统治地位的民族。显然，这个实际情况也决定了，击败了帖木尔帝国，并不等于战胜或者是吞并了这个庞大的帝国，如果明帝国最终要吞并这块土地的话，那么明帝国就会代替突厥蒙古人的位置，并且继续遭到其他各民族的反抗！
这些问题。让朱祁钰都很头痛，解决的办法不是没有，一个很简单地办法，就是从国内移民到这边来，改变这一地区的民族结构。不过，这更不现实。明帝国本身人口规模就偏小，国内很多地方都荒无人烟，而且，就算有多余的，愿意移居到外地的国民，那么也应该首先占领南方的澳洲，以及即将发现地美洲大陆，这样不但能够更迅速的扩大帝国的领土。而且还能给帝国带来更多的资源，要远比移民到一块已经有了不少原住民的地方划算得多吧！
在经过了深思熟虑之后，朱祁钰决定不吞并帖木尔帝国。但是要控制这个国家。显然。要达到这样的目的，那就只有一个办法，一个类似与对付日本的办法。也就在朱祁钰准备要这么下手的时候，新的问题产生了，毕竟不是每一个人都与朱祁钰的想法一样，也不是每一个帝国的将领与官员都有皇帝那么长远的目光！
远征军将领中，绝大部分赞同吞并帖木尔帝国。就连那些为皇帝马首是瞻地年轻将领也都这么想。在这些将军看来，动员了这么多兵力。耗费了这么大的力量，花费了近十年的时间。最后终于击败了帖木尔帝国，将其君主赶到了西北角的偏远沙漠里面，那么为什么不吞并这块土地？这可是用帝国官兵的鲜血与生命换来的土地，为什么到手之后还要放弃呢？显然，这些将领的想法还是很传统地，认为到了一块地方就要占领这里，将其划入帝国的版目范围之内，这样，他们的征战行动才有意义。
也就在这些将领猜测着皇帝的想法，朱祁钰也正在考虑着应该用什么办法来宣布自己地决定，同时又不引起将领太大反感的时候，一名从国内赶来的官员帮了朱祁钰的大忙，这就是于谦派来协助皇帝解决占领区问题的朱文正，当然，他也带来了于谦的看法！
“日本的问题基本上已经处理妥当了，上杉谦信将军的幕府现在虽然还没有完全控制日本，不过，天皇已经下了最后通牒，要求各地贵族，官员放弃私人武装，并且交出所有武器，另外，日本中央军都已经部署到位。上杉将军的军事才能是不需要怀疑的，而且现在那些负隅顽抗的贵族都是单独力量，如果最后必须要通过武力镇压的话，问题也不会很严重。”朱文正喝了口水，又说道，“于大人这次派我到西北来，就是考虑到陛下可能会遇到麻烦，不知道臣有什么地方可以效劳的？”
朱祁钰笑着看了朱文正一眼，然后语重心长地说道：“朱大人，这一路上，你也应该看到了，这次征战，虽然耗时不多，军队的损失也不是很大，不过问题却很突出，我们在这么短的时间内就占领了这么大一块地盘，怎么处理占领区，这成了让朕最头痛的事情。”
朱文正点着头思考了一下，笑着说道：“陛下的意思是，我们不能吞并帖木尔帝国？”
“朱大人，那你的意思呢？”
朱文正没有急着开口，思考了好一会，他才说道：“陛下，臣认为，吞并帖木尔帝国有一个好处，这就具能够扩大帝国的疆土，不过，臣要反问一句，帝国的疆土是越大越好吗？”
朱祁钰苦笑了一下。“那么，朱大人与朕的想法是一样的了，不过，并不是每一个人都这么想啊，特别是那些跟随朕征战沙场的将领可都不这么想。”
这下，朱文正明白了过来。“陛下，此事无须担忧，如果陛下不好处理的话，那么臣愿意代劳。”
朱祁钰微微皱了下眉毛，没有急着答应，而是重复了上一个问题。“朱大人，你认为我们应该怎么处理这块新占领的土地呢？”
“办法无非两个，一是仿照蒙古部落西迁的办法，将这一土地吞并，纳入帝国版图，并且在这里设置政府部门，以及留下军队。二是仿照对付日本的办法，扶持一个新的政权，并且通过这一政权来控制该地区，而我们只是幕后操作，并且从中渔利。”朱文正长吸了口气，“两者比较，臣认为后一种办法更为可靠，这样不但能够缩小我们的驻军数量，而且还能强化对这一地区的统治，更重要的是，这能够更快的将战争胜利的果实转化为现实中的利益，为帝国带来好处，而不是使帝国陷入到一个新的泥潭中去！”
朱祁钰慢慢点了点头，不过仍然在沉思着，而没有回答朱文正开始的话。
“陛下，于大人也是这么想的，而且这次于大人派臣来，就是考虑到陛下不好出面解决这一问题，所以让臣来代劳！”
朱祁钰又看了朱文正一眼，这才说道：“朱大人，你一路辛苦，这些事情，我们等几天再商议，现在你先去休息吧，如果有事，朕会派人来找你的！”
让朱文正没有想到的是，也就在他觐见了皇帝的第二天，朱祁钰下诏，宣布了对帖木尔帝国的态度，同时这也是一个新的占领政策。在采用了大部分日本经验的同时，朱祁钰在其中新增添了一个办法，那就是在帖木尔帝国设置总督府。换句话说，就是在扶持帖木尔帝国皇室新成员建立新的中央政权的同时，在这里设置明帝国的总督府，由总督府统一负责管理明帝国在这一地区的事务，并且维护帝国的利益。名义上，明帝国总督府与帖木尔帝国新政府是两个同等国家的平行政府机构，不过，总督府在权利上是凌驾于帖木尔帝国政府的，而且明帝国总督在获得了帝国皇帝的授命之后，可以废除帖木尔帝国的君主，并且选出新的君主来！显然，明帝国总督府是最高统治机构，而由明帝国扶持的帖木尔帝国的君主只不过是一个如同日本天皇一般的傀儡罢了。
当朱祁钰宣布了这一政策之后，当然有人不满，不过这是皇帝的决定，而那些帝国将领，特别是新生代的年轻将领的不满也就仅仅是不满而已。随后，朱祁钰将处理帖木尔帝国善后的事情交给了朱文正处理，自己则开始着手对莫卧儿帝国的战争准备工作了。