之所以上条清定会安排八条房繁、宇佐美定胜两部作为先手役，就是因为龙捷备、虎捷备两支常备军势的战力以及士气远远高于其他军势，而且这两支常备的装备也是仅次于马廻众。就算遭到敌军围攻，至少还能支撑一段时间，不会像那些参阵诸将的军势一触即溃。
另一方面，清定为了增强八条宪繁所部的战力，特意将府中长尾家马廻众的小岛入道部调配给八条宪繁来节制。
八条宪繁、小岛入道二人看着不断涌来的昭田军并没有丝毫的胆怯。尤其是八条宪繁，他更是对着身后的军势高声吼道：“今日之战，虽然凶险万分，我等唯有决战而阵，万死而后生！”
随后，八条宪繁、小岛入道二人就抽出腰间的太刀，率军向着不断迫近的昭田军冲去。
其中，小岛入道才元服的儿子小岛贞兴更是初生牛犊不怕虎，手持一把野太刀不停的挥舞着，所过之处人马俱被斩断。
八条宪繁、小岛入道二人更是身先士卒，所向披靡，接连斩杀了十余名昭田军足轻。他们身旁的上条军武士、足轻更是不甘落后，各自手持长枪、打刀如墙而进，无不是奋勇当先，死战不退。一时间，阵前血肉横飞，无人可挡。
随着八条宪繁、小岛入道两部加入混战后，昭田军的攻势被彻底遏制，上条军也因此稳住了阵线。
黑田秀忠不甘战场主动权被上条军夺走，就令其弟金津佑高率本部军势以及自己的马廻众一部突袭上条军本阵侧翼。
在望楼之上站着着上条清定见状当即下令后阵待命的八条春纲、八条能重两部出击。
法螺声很快从上条军本阵后方缓缓传来，声音沉闷悠扬，如铁如刀，刺破苍穹。
八条春纲、八条能重两部军势很快就以泰山压顶之势，向着昭田军扑面而来。上条军占据着地形优势，居高临下，速度更快。而金津佑高所部位于山脚，虽说他麾下还有一些骑马武士，但数量和质量明显不如八条春纲、八条能重两部。
为了大量杀伤昭田军的骑马武士，八条春纲、八条能重二人也顾不得战后夺取敌方战马，直接下令麾下的武士、足轻向着敌方不断持弓抛射，随即射倒了一批战马。
一轮箭雨过后，两军的骑马武士也碰撞在了一起，一匹匹战马在高速冲击下沉重摔倒，马骨、人骨碎裂声更是不绝于耳，鲜血飞溅四起，枪杆不断折断飞往半空中，刀刃划过铠甲发出的阵阵刺耳之声。
八条春纲、八条能重凭借着所占据的地理优势，仅仅一个冲锋就冲散了金津佑高部的阵型，并不断向前突进，直至将金津佑高部完全凿穿。
在凿穿金津佑高所部后，八条春纲、八条能重二人也不做太多的纠缠，又率军向着与昭田与七郎鏖战的八条宪繁部冲去。
此刻的八条春纲、八条能重两部如同排山倒海一般的气势，很快就击穿了昭田与七郎所部的侧翼。
不少昭田军足轻、农兵见己方逐渐处于劣势后无心恋战，纷纷丢盔弃甲逃离战场。
小岛贞兴在混战中表现异常显眼，随着他手中的野太刀挥舞之处，铠甲如同纸片一般破碎，就算是遇到敌方的骑马武士，他更是手起刀落，将马匹与人体切割。
随着混乱在昭田军阵中不断蔓延，黑田秀忠也算是追随长尾为景参加过一些规模较大的合战，他明白眼下昭田军大势已去。击溃其实并不可怕，只要不被聚歼，待战后收拢败军，再休整一段时间后，还是能再与上条军一战的。
于是，黑田秀忠急忙下令向府中一带撤退。
可是，随着八条春纲、八条能重两部的加入混战，就使得昭田军没有多余的兵力来牵制八条房繁、宇佐美定胜两部。
八条房繁和宇佐美定胜可不愿意放跑了黑田秀忠、金津佑高等贼首，直接率龙捷备、虎捷备两支常备军势击溃了面前的昭田军后，就将昭田军的退路进行封锁。
兜巾山上的清定见己方完全取得优势后，便下令黑金景信、藤目胜久二人率一百余马廻众出阵，绞杀正在溃逃的昭田军败军。
到了傍晚时分，合战才宣告结束。
尾神岳、兜巾山一带积尸数里，血流成河，马嘶如云，一片惨象。昭田军的武士、足轻、农兵、阵夫等被讨取的人数高达两千余人，粮草辎重更是尽数丢弃于尾神岳。
至于昭田军诸将的结局并不一样：昭田家勇将昭田与七郎在混战之中被小岛贞兴一刀斩于马下；松之山大隅守被宇佐美定满所部枪足轻刺于马下被讨取；上原兵库意图率部突围时被八条能重所部弓足轻射杀；海老名弹正、野泽藤右卫门、长部高长、风间高盛等羽茂本间家诸将更是在逃离战场之际遭到落武者狩，首级也以二十贯文一个的价格卖给了上条军。
黑田秀忠、金津佑高二人在战局愈发不利之际，就直接抛下了己方军势不管，带着十余名马廻众逃回了春日山城，他们在途中根本不敢丝毫停留，生怕遭到落武者狩。
上条军则是在清定的命令下乘胜追击，一路接连收复荒城、虫川城、江守城、直峰城、唐野城、大间城、雁金城、池舟城等二十余座城池兵砦。
经此一役，上条家极大打击了昭田家的锐气。
当天夜里，清定还安排麾下军势收敛在尾神岳、兜巾山一带中阵亡的将士，并刊石立碑，嘉奖己方阵亡者的功绩，让米山寺的僧人们做法事。同时，清定的仁心也推及敌人，昭田一方的阵亡将士在经过首实检后也被一并掩埋。
原本，当长尾晴景、上杉定实这对翁婿逃出颈城郡后，越后诸将大都以为府中长尾家、越后上杉家已经无法复兴，因此不是拥兵进行观望就是选择倒向昭田常陆介、长尾俊景一方。
等到上条军于尾神之战大胜的消息传至整个越后七郡后，柿崎景家、加地春纲、黑川清实、中条藤资、安田长秀、山浦主水正等下越诸将纷纷率军前来与上条清定进行合流，或者是送来粮草辎重以资军用。
一时间，上条军势力大增，昭田一方则从此战开始由盛转衰。