开封府这场亘古未有的官员选拔考试，共有近百名秀才、童生报名参加。其中有一部分已经在前几天主动担任胥吏，也有一部分是听说有俸禄以后才参考的。其实朱由检的原意，是想让更多的人参加选拔；但为了能尽快“生米煮成熟饭”，他不得不依着范景文的建议做出妥协，把未入流官的选拔标准定为童生以上。
这样有一部分能力出众却没怎么读过书的胥吏，就被挡在了选拔大门之外。比如前两天选出来的吏房长吏李二，过去是店铺学徒，当然不可能是童生，但既识文断字，又精通账簿之学。这次无法参考，自是非常遗憾。
好在除了未入流官以外，开封府还选拔二百名雇员。雇员就相当于过去的胥吏，唯一的不同是纳入吏部管理。
雇员的选拔就没什么要求了，只看工作能力。像李二，很轻松就获聘户房财政使下属的雇员，具体的业务财政使还得向他请教。
各未入流官都有下属雇员，下属最多的是公安使，这些雇员就相当于过去的衙役。当然，参考者多而入选者少，通过选拔的欢呼雀跃，因为从此以后就有了一份衙门里的工作，有稳定的收入。
别看未入流官月薪只有三石，雇员只有一石，但朱由检特批：该批官吏薪俸不按照官府的旧规折钞折物、变相克扣，而是按照三两一石的折价发现银。那么雇员的月薪就是三两，养家糊口不成问题；未入流官则达到九两，足可略有积蓄了。
没被选中的则遗憾叹息，不过阎尔梅告诉众人，今后根据实际需要，未入流官和雇员的数量可能还会增加；另外如果有新选官吏不称职，也会随时替换。他请众人不必灰心，在当前的赈灾中好好表现，则仍有再次参考的机会。
仅仅一天，增官雇员的工作便完成了。身份的转换，让这些未入流官和雇员吃了定心丸，投入工作也更加努力。当然，现在开封府还属于战后重建阶段，很多事务还无法展开，眼下最重要的还是赈济安抚难民。此次改革的效果，也许要到几个月以后才能慢慢显露出来。
在开封府忙得热火朝天的同时，朱由检也没闲着。他不管具体的民政，让阎尔梅放手去做，但军政他必须亲自处理。
首先是处理俘虏。城破之时叛军仓惶逃窜，洪兵跑得快，却让其他卫所士卒当炮灰，最后除了战死以外，还被俘虏了数千。对这部分俘虏，朱由检并不打算像洛阳一样，直接改编成大明军。因为他们和洛阳官军不一样，洛阳是朱常洵僭位，这些官军并不知道真正的皇帝朱由检没死；而这些兵已经和官军打了七八天仗，明知皇帝御驾亲征，仍然负隅顽抗，那就是不折不扣的造反了。
按照《大明律》，谋逆者不问首从一律是死罪。但是朱由检也不想把这些叛军全部处死，因为他们和异族侵略者或是流贼还不一样，可以说就是一群没有灵魂、不知道为谁而战的人，当兵只为拿饷，上边让他们干什么，他们就干什么，而且还干不好，真是可恨、可怜又可悲。说到底，他们毕竟是大明子民，而且还有众多军户眷属，牵涉甚广，朱由检是真舍不得杀。
但是对叛军里面的骨干分子，也就是那些曾经的卫所将官，朱由检绝不手下留情。开封城刚一破，他就命卢象升全城搜捕叛军军官，重点是河南都司都指挥使许定国。
和许多武将一样，这个许定国也是军户出身，荫袭父亲的官职，小小年纪就做了千户。由于他为人圆滑，善于逢迎媚上，尤其能拍魏忠贤的马屁，前几年已经升到河南都司都指挥使，是河南全省卫所的最高军事长官。
像许定国这样的地方军事长官，还赶不上祖大寿那样的边军军阀。祖大寿虽然也吃空饷，但最起码是实打实和鞑子作战了。许定国可好，空饷吃得欢，流贼打到河南时，先是装聋作哑假装不知道。朝廷实在催得急了，则开始找种种借口搪塞推脱，如官军无饷、军械无备、需要守卫城池等等，反正就是不敢打仗。像前两年张献忠围攻洛阳，许定国就在开封坐拥二万卫所官军，硬是缩在城里没动窝，最后反倒是北直隶大名府的卢象升来解围。
如此腐败无能的将领，朱由检早就想撤换了。但是登基以后大事一件连着一件，尤其是放弃辽东、西南平叛、京师保卫战，恶战一场连着一场，朱由检只能把主要精力投向边军和京营。至于内地卫所官军，暂时还是以稳为主，等以后腾出手来再好好治理。
没想到朱由崧、洪承畴突然造反，这个许定国不但不率部奋力抵抗，反而被朱由崧用高官显禄美女收买，很快便倒戈成了叛军，协助洪承畴守开封。他是河南卫所最高军事长官，自然影响极为恶劣，带动不少卫所军官也都反叛。
因此朱由检对许定国恨得牙根都痒痒，早就下旨革除他一切官职，没收全部家产，并告诉卢象升攻破开封后一定要抓到许定国，活要见人，死要见尸。谁知许定国十分狡猾，跟着洪兵一起逃跑了，卢象升自然搜不到，只抓了一批守备、千户、百户等中低级武官。
移驾开封后，借着这个机会，朱由检下诏：第一，从今以后，所有在册武将及军卒犯罪，一律由锦衣卫审理，审完后直接定罪并上呈御批。即使是高官，也无须再经过刑部、大理寺和都察院会审。这就等于赋予了锦衣卫“军事法庭”的功能。
第二，重申各省都司直接归五军都督府管辖，换句话说就是直接归兵部管，而不再受各省巡抚节制。此举进一步把地方军政和民政分开，藩司、臬司、都司三司并列的历史就此终结。
在这一点上，朱由检是绝不含糊的。他深知“枪杆子里面出政权”，军权必须完全握在自己手中！