当畠山骏河守等人勾结加贺一向一揆众，并率大军攻入能登之后，能登四郡以及北射水郡不少匠作畠山家的家臣们都认为此次畠山义续凶多吉少，因此纷纷拥兵观望，坐视畠山骏河守等人围困七尾城。
等到清水原之战大捷的消息传来后，奥能登、北射水郡等地匠作畠山家家臣们纷纷率军前来与八条景定所率的上杉军合流。一时间，上杉·畠山联军势力大增。
此时七尾城已经解围，上杉·畠山联军遂乘胜长驱，接连扫平一向一揆军在七尾城外围所占领的城池兵砦。
就连畠山骏河守之前派出去运输粮草辎重的军势也全部被上杉·畠山联军一一歼灭。畠山骏河守等人见此情形，忧懑万分，又不知道该如何应对，只得每天数次向神佛祈祷，又不断的布施周边寺庙的僧人，希望自己能得到上天的保佑。
而此时此刻的一向一揆军则因为粮草将尽，开始渐渐分崩离析。先前畠山骏河守布置在羽咋郡、鹿岛郡各处要地的守军纷纷溃散逃离，争先恐后的往加贺方向逃亡。能登四郡的形势对于越后上杉家和匠作畠山家来说可谓是一片大好。
景定在切断一向一揆军的粮道之后则没有急着去攻打固守在胜山城的畠山骏河守等人，而是派遣内山满久率骑马武士们不断的袭扰胜山城内的守军，并且让轩辕众加藤段藏等人潜入城内烧毁胜山城城内的所有府库。这就使得胜山城内的一向一揆军上下皆是惶惶不可终日。
另一方面，从清水原死里逃生的畠山九郎可是非常清楚上杉军的战斗力，深知己方的这些由门徒众所组成的大军根本不是上杉军的对手，甚至还有了向匠作畠山家投降的想法。
与畠山九郎一同逃入胜山城里的残兵败将们也都在清水原上见识过上杉军那极其强悍的战斗力，在城内四处散播：“上杉军至矣，当避其锋！”
随着能登四郡的形势对一向一揆众愈发不利后，畠山骏河守自知难以与上杉·畠山联军继续抗衡，只能弃守胜山城撤回加贺重整旗鼓。
然而，畠山骏河守并不知道先前主动投降自己的末森城城主土肥但马守已被畠山义远所劝降，能登加贺两国的边境一带也被匠作畠山军完全封锁起来。
九月十五日，就当畠山骏河守、畠山胜禅寺、畠山九郎、下间赖清等人率仅剩的一万余门徒众离开胜山城，意图先退至羽咋郡的中川馆收拢败军从长计议。但是，他们在撤往中川馆的途中却被上杉·畠山联军所发现。
景定当即下令内山满久率四百五十余名骑马武士一路尾随追击一向一揆军，并且于原山赶至一向一揆军的前方，切断一向一揆军的前路。
同时，景定还率上杉·畠山联军一万六千余军势从一向一揆军的后方发起了猛攻，内山满久所率的骑马武士们则是从一向一揆军的正面发起突袭。其中，神保长职、神保氏张等越中神保一族的武将们表现极为活跃，他们深知此次若是作战不力的话很有可能连南射水郡的领地都会被越后上杉家所没收，故而皆身先士卒率部杀入一向一揆军阵中。
本就士气低落的一向一揆军在遭到上杉·畠山联军的两面夹击之下瞬间溃败，以至于相互践踏，十多里的范围内全是尸体，被讨取的多达三千余人。畠山骏河守、畠山胜禅寺、畠山九郎等人也都在乱军之中先后被讨取，而下间赖清则是孤身一人逃回了加贺。
经此一役，加贺一向一揆众元气大伤。这也是加贺一向一揆众自九头龙川之战后又一次对外战事的惨败，就连本愿寺坊官下间家滴流的下间赖俊都在清水原一战中被上杉军所讨取。
而瑞泉寺证心、胜兴寺显荣等人早就在境川之战中见识过了上杉军的实力，他们在装模作样的调集了五千余门徒众进驻邻近射水郡的稻叶山后，就不再继续前进，静观事态的发展。
他们一听闻能登境内的一向一揆军屡战屡败，以及本愿寺坊官下间家的滴流下间赖俊被讨取的消息后，根本不愿意再次与凶神恶煞一般的上杉军交战，当即遣散军势返回了各自的领地，再也不顾盟友的死活了。
景定在听闻越中一向一揆众首领瑞泉寺证心、胜兴寺显荣等人已经各自遣散军势返回本领之后就开始着手准备攻入佛国加贺了。
九月十九日，就当下间赖清仅以身免，孤身一人逃入尾山御坊之后，七里赖周、杉浦玄任、超胜寺实显、光德寺乘贤、下间寿法等加贺一向一揆众首领们便得知了三万余加贺一向一揆门徒众全军覆没的消息，一时间整个加贺四郡震骇。
“如今丹后法桥与三万余门徒众皆阵亡于能州，越后上杉家与匠作畠山家的大军随时都有可能攻入加州，越前的朝仓家曾与府中长尾家结为攻守同盟，也不能不防。”超胜寺实显说完便长叹了一口气。
“不如我等还是尽快派使者前往总本山，请法主出面调停吧，不然的话一旦上杉·畠山联军攻入加州，后果将不堪设想啊！”光德寺乘贤随即想到了一个办法。
“不可！加州四郡各地尚且囤积大量粮草辎重，位于边境的城池兵砦也都在数年之前进行增筑普请，如今只需调集石川郡、能美郡两郡的门徒众进入河北郡各地的城池兵砦固守即可。八条中务大辅所率的越后势、越中势孤军深入，军势虽众，内实空虚，意在速战。我军当笼城固守，以挫其锋，待其粮尽技穷，自会退走。”作为加贺一向一揆众中的主战派，杉浦玄任已经看出来越后上杉军的弱点。
“杉浦壹岐法桥殿说得倒是轻巧，不如你自率一军前去能州便知上杉军之实力了。”下间赖清听完杉浦玄任的话后不禁冷笑了一下后说道。
“下间筑后法桥殿此言谬矣，八条中务大辅麾下之精兵控鹤军战力强悍，如今扬名越后、岩州、磐州、佐州等地，八条中务大辅每战更是必以控鹤军为先手。眼下我等只能据险而守，以挫其锋。若是出城迎敌必然与九头龙川之战、清水原之战、原山之战等合战一样惨败收场。”杉浦玄任并不赞同主动出击，加贺一向一揆众历次主动出城迎战或是攻入他国几乎都没有什么好结果，胜少败多。
“八条中务大辅此次率越后上杉军出阵能州可是水陆并进，越后水军众几乎是倾巢而出，我等如何抵御？其麾下控鹤军的骑马武士更是陷阵却敌，骁勇无比，恐怕加州四郡诸将之中没有哪一家的骑马武士能出其右者。若是让其长驱直入，捣毁加州四郡的寺社，烧毁府库，我等将难以为继。”下间赖清摇了摇头后无奈的说道。
“不如这样吧，由杉浦壹岐法桥殿调集石川郡、能美郡两郡的门徒众前往河北郡驻防，下间筑后法桥殿前去总本山请求法主出面与越后上杉家、匠作畠山家等北陆诸侯达成和议，前提是必须向法主说明我等也是为了保护能州四郡的信徒才不得已出阵能州的。让上山田城城主广濑伊贺守出使越中，让瑞泉寺和胜兴寺出面劝说八条中务大辅收兵。”这时，加州大将七里赖周想到了折中的办法。
一方面让杉浦玄任率军前往固守河北郡的防线，防止上杉·畠山联军攻入。另一方面，分别派遣使者前往越中和大坂本愿寺，由他们出面仲介斡旋加贺一向一揆众与越后上杉家和匠作畠山家的停战一事。
“眼下那就只能如此了。”杉浦玄任也觉得七里赖周的提案很合理，毕竟加贺一向一揆众在能登新败，损兵折将，士气低落，急需时间休养生息，无法持续与匠作畠山家、越后上杉家、朝仓家等这样的北陆道大名交战。
若是此次加贺一向一揆众在能登取得大胜，并且将能登一国也像加贺一样转变为佛国的话，一向宗的总本山大坂本愿寺方面也就默许了他们的所作所为。可是此次加贺一向一揆众在能登的惨败导致现任法主本愿寺证如都无法继续视而不见听而不闻了。
就在这时，畠山义续所派遣的家中政僧安国寺留云斋也刚好抵达了石山御坊，向本愿寺证如说明了加贺一向一揆众屡次介入能登四郡之事，希望本愿寺证如能够禁止加贺一向一揆众的势力进入能登。
本愿寺证如也得知越中一向一揆众在境川惨败、加贺一向一揆众在能登惨败的消息后，大惊失色。他其实也不希望加贺、越中两国的一向一揆众逐渐失控，随即严令越中、加贺两国的一向一揆众禁止协助匠作畠山家的家臣们争权夺势，甚至不准擅自出兵进入能登四郡，违者将尽数破门处置。