明石姫离开之后，商毅又立刻下令驻守仙霞岭的段鹏，严守各处福建通向浙江的隘口，禁止任何人员出入，以防清军乘虚攻入浙江。
虽然商毅不想接纳朱聿键，但并不能明目张的阻止朱聿键一行来到浙江，只能够釆用这种封锁边境，禁止出入的做法，如果在这种情况下，朱聿键还能克服重重困难，从福州来到杭州，那也就没有别的办法了,只能说是天不该绝他。不过这种可能性确实不大。
当然现在商毅也不可能把所有精力都放在朱聿键的身，湖北的战事才是当前的重点，两天以后，商毅收到了湖北地区发来的捷报，知道商家军挫败了清军对湖北战区的第三次进攻，又取得了辉煌的战利。由其是现在南方在湖南、江西的战场连遭败绩的时候，这一次商家军战斗的胜利，也就更显得难得了。
虽然湖南、江西并不属于商家军的地盘，但总体来看，都同属于南明的阵营，和浙江也存在着唇亡齿寒的关糸，南明在湖南、江西战场的失利，对浙江也造成了不小的影响，不过湖北的胜利，也使整个浙江再一次被轰动起来，加【杭州时报】又大力宣传，也大大冲淡了这些失败带来的消极影响。
而商毅也开始认真思考李岩和李定国提出，夺取黄州，全面控制黄州府的建议。
虽然在当初商家军跃进大别山，开避湖北战区的时侯，商毅是禁止夺取大城市，以避免引起清军的重视，因此商家军有好几次可以夺取黄州的机会，但都放弃了。当然这一招也确实发挥了不小的作用，在清军前两次征剿湖北战区时，都对商家军的实力出现了估计错误。不过现在的情况己经大不相同了，再连续三次击败清廷的进剿，由其是这一次，清军己经出动了六七万的庞大兵力，依然还是被商家军打得大败，湖北战区还想不被清廷重视，都是不可能了。
而且三旅到达湖北战区之后，使湖北战区的正式兵力达到近三万人，而且像九师、三旅都是久经战阵的部队，战斗力很强，同时整个黄州府地区，除了少数几个州府县城以外，基本都在商家军的控制中。而且这时洪承畴己南进江西督战，多铎又要坐镇南京，不能轻动，黄州的清军新败，士气低落，可以说现在夺取黄州的时机己经成熟了。
一但商家军夺了黄州，全面占领黄州府，不仅能够使目前整个湖北战区进一步得到稳固和发展，同时还可以为下一步复夺南京打下一个良好的基础，因此无论是对现在还是将来，都是大有益处的。
但商毅也考虑到其中不利的因素，尽管这次清军又进剿失利，还损兵拆将，但目前在湖北依然还有三万六七千兵力，而攻打黄州可是攻城战，并不像在野战中可以大范围运动转移，调动清军的兵力，寻找有利战机，只能硬拼硬，不管有利无利都要打。如果因为攻打黄州，而过多损失兵力，那可就得不偿失了。
而且湖北战区的商家军刚刚打败清军的进剿，弹药的消耗量也很大，同时还缺少重型火炮，是否能支持攻打黄州，也未必可知，因此最好是能够先给湖北战区补充一批弹药武器，然后再实施攻打黄州的计划。
而就在这时，南京、北京的情报系统都传回来消息，清军的第二批援军己经出京南下，目前己经度过了淮河，进入凤阳府地区。
在北京期间，多尔衮曾承诺给洪承畴拔调十万人马南下，但由于大军调齐需要时间，因此在洪承畴出京南下的时候带来了五万人马，现在剩下的五万人马也终于都被派出南下。而这一次清军的领军主将可是历史赫赫有名的人物，就是满州镶黄旗梅勒额真，巴牙喇纛章京，号称满州第一巴图鲁的鳌拜。
商毅得报之后，也是忧喜参半，因为清军再次出动大军南下，就意味着北方的留守兵力进一步空虚，这样自已跨海突袭计划的成功率，也就会大大的増加，但在目前的情况下，这一支人马加入南方，势必又会増强清军的实力，由其是现在湖北的商家军刚刚击败清军的进剿，正是兵力疲惫，弹药缺乏的时候，这支人马如果被清军投放到湖北战区内，可以立刻使湖北战区的局势发生完全逆转。
因此商毅立刻回复李定国和李岩，告诉他们鳌拜己经领军南下的消息，让他们暂缓实行攻打黄州的计划，先迅速整编修整军队，严守目前的地区，防止鳌拜部加入湖北战区。同时也告诉他们，浙江将会在近期内打通水路，运送一批弹药到湖北来，以増援湖北地区的战斗力。并且会再向南京地区发动一次进攻，给南京制造压力，迫使多铎把鳌拜部调到江南来驻防南京。然后再视战局而定，是否攻打黄州。
回信发出之后，商毅立刻招集长江舰队的统领黄震，以及三名分舰队的指挥官，询问长江舰队的准备情况，能不能马和清军交战。
经过了两个多月的准备，把原计划组建海军第六分舰队的新战舰，也都大部份补充到长江舰队来，并且又增加了一部份士兵之后，长江舰队基本己经恢复到刚组建时的规模。
不过黄震等人在商议之后，决定将三个分舰队的编制又重新调整了一下，第一分舰队拥有三级巡洋舰二艘，四级驱逐舰十五艘，五级护卫舰八艘。共计战船二十五艘，主要是付责仍然足在长江入海口至南京段江面作战。而第二、三分舰队分别包括有四级驱逐舰二艘，五级护卫舰三艘。六百料以下战船十二艘。三百料以下战船二十艘。共计各有战舰三十七艘，主要是付责深入长江中游江面作战。
釆用了新的编制以后，第一分舰队虽然没有一次编制的战舰数量多，但却没有小型战船，实际的战斗力反而増加了不少。而第二、三分舰队的战船也有所增加，总计战船数量也达到了九十九艘。
听商毅介绍了目前的战局之后，黄震、何滨、易吉轩、南亚虎等四人也知道现在重新打通水路的重要性和紧迫性。不过在一次水败仗之后，整个长江舰队下都非常不服气，也憋足了一口气，一定要向清军把这个败仗讨回来，而且在这两个多月的时间里，全舰队都在努力的训练如何应对清军的火船进攻战术。
他们到是没有想到，报仇的机会这么快就来了，因此也都立刻向商毅表示，长江舰队己经完全做好了准备，这次出去，一定狠狠教训一下清军。报一战败仗的一箭之仇。
见到长江舰队的指挥官们并没有因为一战的失败而气馁，依然保持着高昂的士气和斗志，商毅也十分高兴，不过商毅也知道，光凭血气之勇是不能战胜清军的，而且在有的时候，战意过于旺盛，也未必就是好事，因此也问他们打算釆用什么样的战术来对付清军的火船战术。
黄震当然不会是只懂说大话，其实这两个多月的时间里，他一直都在思考如何应付清军的火船战术，并且和何滨、易吉轩、南亚虎都作过详细的研究和试验，这时也早己是胸有成竹了。因此一见商毅问起，立刻和何滨、易吉轩、南亚虎等人在模拟沙盘演试了一番。
看完了黄震等人的演试之后，商毅也觉得十分满意，按这样的战术，确实可以对付清军的火船战术，也可见黄震等人确实是下过一番苦功夫。因此也可以放心，于是商毅也立刻下令，让长江舰队再次出击，主动向清军发动进攻。
同时也和黄震等人商议决定，这一次长江舰队还携带一部份弹药武器物资出航，一但击败了清军的水师之后，就由第二或是第三分舰队立刻逆江而，将这些物资运送到湖北战区去。
领命之后，黄震、何滨、易吉轩、南亚虎等四人也立刻连夜出发，回到通州，准备率舰队出击。
当然要给南京制造压力，不仅仅只能依靠长江舰队的力量，在陆路同样也要对南京的外围发动攻势，才能造成足够的声势。另一方面也是为下一步收复南京做准备。
因此商毅又下令驻守常州的杨武丞，再次进攻镇江，而这一次可不是试探进攻，如果清军从南京来支援镇江，就在镇江府境内与清军对持，那怕与清军决战也再所不惜。
同时又命驻守广德州的成进率军出击，进攻宁国府。一但商家军攻下宁国府，南京就有被商家军完全包围的危险，因此这两路进攻，都是清军必救之地，也不怕多铎不调鳌拜渡江増援南京。
当然最关建的一战还是水战，如果商家军不能击败清军的水军，重新打通和湖北战区的水路联系，就无法向湖北战区提供支援，就算鳌拜部被调到南京，湖北战区的局面也就不容乐观。
因此双方的水军再次较量的胜败，也成为这一次的焦点之战。